Pomimo usilnych starań i skoków w czasie, Takemichi Hanagaki ciągle nie jest w stanie zapobiec śmierci Hinaty Tachibany, swojej młodzieńczej miłości, w teraźniejszości. Dorosły Takemichi zmaga się ze żalem i konsekwencjami przestępczego imperium gangu Tokyo Manji – niezamierzonego produktu jego ingerencji w linię czasu. Choć gang działał kiedyś pod wodzą idealisty Manjirou „Mikey’a” Sano, obecnie został przejęty przez złowrogiego Tettę Kisakiego i w rezultacie porzucił swoje pierwotne, optymistyczne intencje.
Pomimo poczucia beznadziei, Takemichi po raz kolejny cofa się do przeszłości, aby zbadać Black Dragon (Czarny Smok), rywalizujący gang motocyklowy, którego działania ostatecznie prowadzą do śmierci Hinaty. Tam poznaje młodego Hakkaia Shibę, kolegę z gangu, którego starszy brat, Taiju, tyranicznie rządzi Czarnym Smokiem. Kiedy Taiju brutalnie bije Takemichiego w jednostronnej ulicznej bójce, Hakkai próbuje wycofać się z Tokyo Manji w ramach przeprosin – jest to akt, któremu Takemichi musi zapobiec, aby oszczędzić Hakkaiowi ponurej przyszłości.
Poprzez wspólną tragedię Takemichi nawiązuje więź z Chifuyu Matsuno, budując bliskie koleżeństwo, którego obaj chłopcy desperacko potrzebują. Mając Chifuyu po swojej stronie, Takemichi pracuje nad rozwikłaniem losów członków Czarnego Smoka, walcząc o stworzenie szczęśliwej przyszłości dla swoich bliskich.