Pewnego dnia krwistoczerwone słońce przestało świecić, wywołując „Zjawisko Zapaści” – kataklizm, który zniszczył miasto Araty Kasugi i sprawił, że wszyscy jego mieszkańcy zniknęli. Jednak nie wszystko jest jeszcze stracone; korzystając z magicznego grimoire’u podarowanego mu przez kuzynkę i przyjaciółkę z dzieciństwa, Hijiri Kasugę, Arata sztucznie rekonstruuje swój świat.
Aby zbadać to zjawisko, przed Aratą pojawia się Lilith Asami, a jego iluzoryczny świat nagle obraca się w niwecz. Chłopak otrzymuje dwa wyjścia: oddać księgę albo zginąć. Arata wybiera jednak trzecią opcję – zapisuje się do tajnej szkoły magii, Królewskiej Akademii Biblia, gdzie czeka na niego sześć innych użytkowniczek magii. Razem z Lilith tworzą one „Trinity Seven” – elitę szkoły, z której każda dysponuje unikalną mocą i umiejętnościami.
Mając za cel uratowanie Hijiri i korzystając z pomocy nowo poznanych przyjaciółek, Arata nie cofnie się przed niczym, by zapobiec całkowitej zagładzie swojego ukochanego miasta i sprowadzić swoją najbliższą osobę z powrotem.
