Minął rok od Czarnej Rebelii – nieudanego powstania przeciwko Świętemu Imperium Brytyjskiemu, któremu przewodził zamaskowany mściciel Zero, obecnie uznawany za zaginionego. Zagubiona bez swojego rewolucyjnego przywódcy, grupa oporu ze Strefy 11 – Zakon Czarnych Rycerzy – okazuje się zbyt słaba, by walczyć z brutalnością, jaką Brytania stosuje wobec „Jedenastostrefowców”. Represje te znacznie przybrały na sile, aby zdławić w zarodku jakąkolwiek nadzieję na przyszły bunt.
Lelouch Lamperouge, który stracił wszelkie wspomnienia o swoim podwójnym życiu, wiedzie spokojny żywot u boku przyjaciół jako uczeń Akademii Ashford. Jego dawna partnerka, C.C., nie mogąc pogodzić się z takim obrotem spraw, bierze na siebie zadanie przypomnienia mu o jego dawnym celu, mając nadzieję, że genialny strateg Zero powstanie raz jeszcze, by dokończyć to, co zaczął.
