Życie dwunastoletniego Koushiego Nagumo nagle legnie w gruzach, gdy po pożarze domu ojciec porzuca go i zostawia samemu sobie. Pozostawiony bez dachu nad głową chłopak traci przytomność na ulicy, ale ekscentryczna kobieta o imieniu Mineru Wachi lituje się nad nim i zabiera go do żeńskiego akademika „Megami-ryou”.
Gdy Mineru – która okazuje się być tymczasową zarządczynią – poznaje sytuację Koushiego, proponuje mu objęcie oficjalnego stanowiska… „matki” akademika. Na miejscu czekają jednak na niego mieszkanki o wyjątkowo osobliwych charakterach: cierpiąca na androfobię (lęk przed mężczyznami), ale łagodna Atena Saotome, wysportowana chłopczyca Kiriya Senshou oraz sama Mineru, której brawura w eksperymentach naukowych nie zna granic. Mimo tych wszystkich dziwactw, Koushi daje z siebie wszystko, by wywiązać się z obowiązków w swoim nowym, szalonym życiu!
