Od śmierci rodziców Shinpei Ajiro mieszkał z rodziną Kofune i ich dwiema córkami – Mio i Ushio. Choć później opuścił rodzinną wyspę, by kontynuować edukację w Tokio, Shinpei wraca po tym, jak Ushio tragicznie utonęła podczas próby ratowania małej dziewczynki. Podczas pogrzebu jego najlepszy przyjaciel informuje go o siniakach znalezionych na szyi Ushio, co rzuca cień podejrzenia na przyczynę jej śmierci.
Podejrzewając morderstwo, Shinpei ponownie analizuje ostatnie wydarzenia, jednak dziwne incydenty wciąż mają miejsce. Znikający ludzie i inne niewytłumaczalne zjawiska sprawiają, że Mio przypomina sobie starą legendę o bytach zwanych „Cieniami”, które mogą nie być jedynie fantazją. Podobno spotkanie ze swoim Cieniem zwiastuje nadchodzącą śmierć danej osoby.
Stawiając czoła mrocznej stronie wyspy Hitogashima, Shinpei sprzeciwia się swojemu ponuremu losowi, by wypełnić ostatnią wolę Ushio – chronić Mio.
