Podczas dyskusji nad poufnym śledztwem, Czwarty Raikage i jego podwładni zostają zaatakowani przez zamaskowanego intruza. Gdy przywódca wioski Kumogakure odpiera atak, przeżywa szok na widok twarzy sprawcy – okazuje się nim być Naruto Uzumaki!
Próba zamachu nie jest jednak jedynym przestępstwem przypisywanym młodemu ninja, który gwałtownie zaprzecza wszelkim oskarżeniom. Aby uniknąć konfliktu dyplomatycznego, Tsunade decyduje się wysłać go do zamku Houzuki w wiosce Kusagakure – więzienia o zaostrzonym rygorze dla przestępców ninja – dopóki sytuacja nie zostanie wyjaśniona.
Mimo że jego moce zostają natychmiast stłumione przez Mui, naczelnika więzienia posiadającego zdolność pieczętowania czakry, Naruto podejmuje brawurowe, choć daremne próby ucieczki. Dzięki pomocy dwójki współwięźniów chłopak uświadamia sobie, że ten legendarny ośrodek odosobnienia skrywa tajemnice znacznie mroczniejsze, niż mogłoby się wydawać. Odkrywszy straszliwy sekret, trio rozpoczyna niebezpieczną operację, która może być dla Naruto jedyną szansą na odzyskanie wolności i udowodnienie swojej niewinności.
