Po wysłaniu z misją zbadania alarmujących zaginięć czterech ninja władających unikalnymi technikami linii krewnej (Kekkei Genkai) z różnych krajów, Kakashi Hatake, Naruto Uzumaki, Sakura Haruno i Sai z powodzeniem odnajdują ich trop i informują o wszystkim Hokage. Niespodziewanie plany Tsunade legną w gruzach, gdy pojawia się Hiruko – mózg całej operacji i były ninja Konohagakure opętany żądzą potęgi. Ogłasza on, że wchłonął unikalne zdolności zaginionych shinobi. Będąc na skraju stania się istotą niezwyciężoną, Hiruko poszukuje jeszcze jednej, ostatniej linii krewnej, zanim rozpocznie wojnę totalną o panowanie nad światem.
Ponieważ dawne powiązania wioski z Hiruko budzą podejrzenia innych narodów co do udziału Konohy w tym spisku, Tsunade otrzymuje ultimatum: musi natychmiast zażegnać kryzys. Pozbawiona wyboru, decyduje się przystać na propozycję Kakashiego, który przedstawia śmiały, choć tragiczny plan – plan, który może wysłać go na pewną śmierć. Naruto kategorycznie sprzeciwia się takiemu rozwiązaniu! Mimo oficjalnej decyzji Hokage, chłopak jest zdeterminowany, by ocalić życie swojego nauczyciela, nawet jeśli przyjdzie mu walczyć zarówno z wrogami, jak i dawnymi przyjaciółmi.
