W Akademii Prawdziwego Krzyża Rin Okumura nieświadomie natrafia na pierwsze oznaki nadchodzącego chaosu: zwykli ludzie zaczynają dostrzegać niewidzialne dotąd stworzenia, które przemierzają ludzki wymiar, Assiah. Podczas gdy Rin postrzega to jako okazję do nawiązania nowych znajomości, jego brat bliźniak, Yukio, czuje się bardziej przytłoczony niż kiedykolwiek. Osaczony przez obowiązki naukowe, misje egzorcysty i posadę nauczyciela, Yukio milczy na temat własnych przebudzonych mocy, nie będąc w stanie pojąć ich skali ani znaczenia.
Podczas gdy Rin i jego przyjaciele przygotowują się do corocznego egzaminu certyfikacyjnego na egzorcystę, Zakon Prawdziwego Krzyża odkrywa pierwszą sztuczną bramę do Gehenny – demonicznego wymiaru. Widząc jej rozmiary oraz zaawansowaną technologię, która umożliwiła jej powstanie, egzorcyści uświadamiają sobie, że mają do czynienia z Illuminati – niezwykle bogatą i potężną organizacją. Co gorsza, zagadkowi Illuminati umieścili trzech szpiegów w strukturach Zakonu, a jeden z nich może ukrywać się wśród młodych adeptów, którzy przysięgli chronić ludzkość przed demonicznym zagrożeniem.
