Po morderstwie ojca, Ryuuko Matoi wędruje po kraju w poszukiwaniu zabójcy. Podążając za jedynym tropem – brakującą połówką jego wynalazku, Ostrza Nożycowego (Scissor Blade) – dociera do prestiżowej Akademii Honnouji, liceum niepodobnego do żadnego innego. Akademią rządzi imponująca i chłodna przewodnicząca rady uczniowskiej, Satsuki Kiryuuin, wraz ze swoimi potężnymi podwładnymi, Elitarną Czwórką. W brutalnie konkurencyjnej hierarchii szkoły, Satsuki obdarowuje tych na szczycie specjalnymi ubraniami zwanymi „Mundurami Goku” (Goku Uniforms), które dają noszącemu unikalne nadludzkie zdolności.
Dokładnie pobita w walce z jednym z uczniów w mundurze, Ryuuko wycofuje się do swojego zniszczonego domu, gdzie natrafia na Senketsu, rzadki i czujący „Kamui”, czyli Boskie Ubranie (God Clothes). Po kontakcie z krwią Ryuuko, Senketsu budzi się, przylegając do niej i zapewniając jej ogromną moc. Teraz, uzbrojona w Senketsu i Ostrze Nożycowe, Ryuuko staje do walki z Elitarną Czwórką, mając nadzieję dotrzeć do Satsuki i raz na zawsze odkryć sprawcę morderstwa jej ojca.
