Przez ostatnie trzy lata szkoła średnia Teikou zdominowała krajową scenę koszykówki dzięki swojemu legendarnemu składowi: „Pokoleniu Cudów”. Składało się ono z pięciu cudownych dzieci, które osiągnęły sukcesy w tym sporcie, ale „Phantom Sixth Man” czaił się w cieniu i pomógł drużynie zdobyć uznanie. Ostatecznie ich ogromny rozwój zniechęcił ich do ukochanego sportu i sprawił, że w liceum ich drogi się rozeszły.
W poszukiwaniu nowych członków, drużyna koszykówki liceum Seirin rekrutuje Taigę Kagamiego i Tetsuyę Kuroko, dwóch pierwszoroczniaków, którzy wydają się znacząco różnić pod względem umiejętności. Kagami, który niedawno wrócił z Ameryki, ma zarówno wrodzony talent, jak i nieustającą miłość do sportu. Tymczasem Kuroko brakuje mu prezencji i nie wykazuje wybitnych zdolności sportowych. Później jednak okazuje się, że jest on Phantom Sixth Manem Teikou – zawodnikiem należącym niegdyś do Pokolenia Cudów.
Kuroko chce udowodnić drużynie Seirin, że jest silny na swój sposób. Widząc jego przekonanie, Kagami tworzy dynamiczny duet z Kuroko, który obiecuje wspierać „światło” Kagamiego jako jego „cień”. Wraz z nowymi kolegami z drużyny Seirin, dążą do zdobycia zbliżającego się mistrzostwa Interhigh, ale powrót byłych kolegów z drużyny Kuroko komplikuje ich plany.
